SCILab共拥有4间实验室(总占地面积约200平方米):综合实验室(B501)、基础实验室1(B666)、基础实验室2(B664)、生物实验室(A558)以学生办公室(占地面积约72平方米)。实验室拥有生物共聚焦显微镜、金相共焦显微镜、原子力显微镜、全电动活细胞工作站、全电动显微镜、倒置荧光显微镜、衍射层析全息显微镜、数字全息显微镜、高速摄影机、红外热像仪、结构光三维扫描仪、 EMCCD、SCMOS相机、光场相机、TOF相机、各类型空间光调制器等仪器设备,硬件设施投入逾3000万元。